Philippe Douste-Blazy s'est beaucoup impliqué, à partir de juillet 2006, dans le conflit opposant le Hezbollah à l'état d'Israël, allant régulièrement assister au conseil des ministres libanais présidé par le premier ministre Fouad Siniora. Il est, avec Jacques Chirac, responsable de la résolution 1701 du Conseil de Sécurité, qui a permis d'instaurer un cessez-le-feu et de déployer les casques bleus.
Le 24 juillet 2006, Philippe Douste-Blazy organise une session du conseil de sécurité de l'ONU spécialement consacrée au douloureux problème des enfants soldats. Il est celui qui a permis de politiser au plus haut niveau la question des enfants soldats. En 2007, il déclare : « Un enfant soldat est d'abord un enfant. Il n'est pas un coupable, il est une victime. Sa place n'est pas dans une caserne, elle est sur les bancs de l'école ». Il en résultera la signature des Engagements de Paris.
En septembre 2006, lors de l'Assemblée générale des Nations unies, il fonde UNITAID. Ce lancement historique rassemble autour de lui une coalition mondiale de haut niveau : le président français Jacques Chirac, le président brésilien Lula Da Silva, et le Président Chilien Ricardo Lagos ainsi que les Premiers ministres Tony Blair (Royaume-Uni) et Jens Stoltenberg (Norvège), associés au présidents Denis Sassou-Nguesso (Congo-Brazzaville) et à Bill Clinton, le tout sous le parrainage du Secrétaire général de l'ONU, Kofi Annan.
La même année, dans la droite ligne des propos du président Chirac sur la nécessité de trouver des nouvelles de financement pour lutter contre l'extrême pauvreté, Philippe Douste-Blazy a créé avec les ministres des affaires étrangères du Chili, du Brésil et de l'Espagne, le Groupe pilote sur les financements innovants, laboratoire d'expertise et outil diplomatique. Le Groupe pilote est un réseau informel d'acteurs volontaires qui rassemble actuellement 66 États et de nombreuses organisations internationales, organisations non gouvernementales, fondations privées et entités locales dédiées à l'éradication de la pauvreté et à la préservation des biens publics mondiaux (santé, éducation, sécurité alimentaire, climat, biodiversité, etc.).
Le Groupe pilote s'inscrit dans l'idée de « partenariat mondial » pour le développement (ODD 17). Son objectif est de créer un espace privilégié de dialogue et de partage de bonnes pratiques sur les diverses solutions innovantes permettant de financer le développement durable.
En s'appuyant sur l'expertise de ses membres et un recensement régulier des initiatives les plus prometteuses, il vise à favoriser une mobilisation politique croissante en faveur des instruments ayant prouvé leur faisabilité et leur efficacité dans plusieurs pays pilotes.
- —Adoption de la résolution 1701 de l'ONU pour le cessez-le-feu au Liban.
- —Fondation d'UNITAID pour l'accès mondial aux médicaments.
- —Signature des Engagements de Paris contre l'utilisation d'enfants soldats.
- —Création du groupe international sur les financements innovants (63 pays membres).